Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKIV2LQ15477 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms