Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SEC23BQ15437 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms