Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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