Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL19A1Q14993 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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COL19A1Q14993 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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COL19A1Q14993 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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COL19A1Q14993 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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COL19A1Q14993 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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COL19A1Q14993 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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