Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms