Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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SEMA3AQ14563 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA3AQ14563 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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