Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCNIQ14094 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCNIQ14094 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms