Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB2AQ13885 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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