Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CDH18Q13634 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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