Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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