Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MTMR3Q13615 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MTMR3Q13615 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms