Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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FOXE3Q13461 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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