Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AP3B2Q13367 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3B2Q13367 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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