Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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