Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUSP4Q13115 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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