Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF1Q13077 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms