Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
COX10Q12887 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
COX10Q12887 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COX10Q12887 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COX10Q12887 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
COX10Q12887 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COX10Q12887 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
COX10Q12887 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms