Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CDH17Q12864 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CDH17Q12864 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CDH17Q12864 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CDH17Q12864 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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