Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms