Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXO1Q12778 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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FOXO1Q12778 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXO1Q12778 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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