Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SREBF2Q12772 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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