Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIF1AQ12756 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KIF1AQ12756 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms