Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms