Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SSRP1Q08945 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms