Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms