Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LOXL1Q08397 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms