Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms