Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXM1Q08050 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXM1Q08050 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms