Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms