Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TFF3Q07654 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TFF3Q07654 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TFF3Q07654 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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TFF3Q07654 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TFF3Q07654 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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TFF3Q07654 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TFF3Q07654 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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