Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms