Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms