Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 308.3 ms