Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms