Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DSG1Q02413 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms