Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms