Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms