Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX1P83916 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX1P83916 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBX1P83916 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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