Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NOMO3P69849 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NOMO3P69849 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms