Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC5A3P53794 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms