Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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