Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN1P49257 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms