Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms