Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ME1P48163 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ME1P48163 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ME1P48163 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ME1P48163 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms