Protein–RNA interactions for Protein: P40197

GP5, Platelet glycoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP5P40197 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP5P40197 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP5P40197 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GP5P40197 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP5P40197 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP5P40197 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms