Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms