Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms