Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRMP28827 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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