Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PTPRBP23467 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PTPRBP23467 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms