Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHCGRP22888 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHCGRP22888 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms